Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L21D6R901 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L21D6R901 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms