Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HMGB1P1B2RPK0 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGB1P1B2RPK0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms