Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NOTOA8MTQ0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms