Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MEIS3P1A6NDR6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms