Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LYVE1Q9Y5Y7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms