Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMED5Q9Y3A6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms