Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FOXD3Q9UJU5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms