Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMG20BQ9P0W2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMG20BQ9P0W2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms