Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFT57Q9NWB7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFT57Q9NWB7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms