Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA4BQ9NPR2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms