Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPL3Q9BY60 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABARAPL3Q9BY60 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms