Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALS2CR12Q96Q35 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms