Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SCGB3A2Q96PL1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms