Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CMTM3Q96MX0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CMTM3Q96MX0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms