Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NXNL1Q96CM4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NXNL1Q96CM4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms