Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFT1Q96AA3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms