Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU3

SGMS2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS2Q8NHU3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGMS2Q8NHU3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms