Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HELBQ8NG08 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HELBQ8NG08 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms