Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DTX3Q8N9I9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms