Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLGN4XQ8N0W4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLGN4XQ8N0W4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLGN4XQ8N0W4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLGN4XQ8N0W4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLGN4XQ8N0W4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms