Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LETMD1Q6P1Q0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms