Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PXDC1Q5TGL8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PXDC1Q5TGL8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms