Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTSL3PQ5NE16 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms