Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SBK1Q52WX2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms