Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RFTN2Q52LD8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RFTN2Q52LD8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms