Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCDC38Q502W7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC38Q502W7 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms