Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UVSSAQ2YD98 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UVSSAQ2YD98 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms