Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL38Q2WGJ6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms