Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PCK2Q16822 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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