Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ME3Q16798 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ME3Q16798 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ME3Q16798 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ME3Q16798 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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