Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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