Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABEP1Q15276 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABEP1Q15276 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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