Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PCM1Q15154 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCM1Q15154 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms