Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAPSNQ13702 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAPSNQ13702 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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