Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 HECTD1-210ENST00000555843 4281 ntTSL 25.39□□□□□ -1.555e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.399e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 GNAI2-205ENST00000441156 2168 ntTSL 226.63■■□□□ 1.859e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.229e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 GNAI2-211ENST00000491100 3886 ntTSL 29.76□□□□□ -0.859e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.432e-8■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.143e-17■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 CWF19L1-206ENST00000478047 2694 ntTSL 211.67□□□□□ -0.543e-17■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 CWF19L1-204ENST00000468709 2402 ntTSL 210.98□□□□□ -0.653e-17■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 CWF19L1-201ENST00000354105 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.963e-17■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 CWF19L1-207ENST00000482452 1606 ntTSL 57.49□□□□□ -1.213e-17■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.192e-29■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.642e-29■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 ZFP36L1-202ENST00000439696 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-8■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 ZFP36L1-204ENST00000555997 3094 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.512e-8■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 SEC11A-206ENST00000558924 3626 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.272e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 SEC11A-207ENST00000559376 2204 nt11.33□□□□□ -0.62e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.251e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 NOP16-210ENST00000619979 963 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.091e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 NOP16-207ENST00000614830 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 NOP16-208ENST00000616685 472 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.381e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 RPRD1B-201ENST00000373433 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.475e-9■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 RPRD1B-208ENST00000618318 567 ntTSL 48.9□□□□□ -0.985e-9■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 RPRD1B-207ENST00000614670 659 ntTSL 36.44□□□□□ -1.385e-9■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.735e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.375e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.245e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 AES-210ENST00000590067 1100 ntTSL 220.75■□□□□ 0.913e-9■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 PRMT1-216ENST00000530361 866 ntTSL 321.16■□□□□ 0.985e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 SRGN-202ENST00000462445 802 ntTSL 210.08□□□□□ -0.88e-12■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 IGF2R-203ENST00000475584 597 ntTSL 318.26■□□□□ 0.512e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.851e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.411e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.411e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 PSME1-210ENST00000561435 945 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.181e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 PSME1-206ENST00000559741 763 ntTSL 312□□□□□ -0.491e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.241e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.131e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 CS-215ENST00000549143 2811 ntTSL 29.43□□□□□ -0.98e-8■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.998e-8■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.158e-8■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 CS-213ENST00000548746 551 ntTSL 57.03□□□□□ -1.288e-8■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.465e-36■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 UBA52-207ENST00000596273 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.355e-36■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 UBA52-201ENST00000430157 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.555e-36■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 UBA52-205ENST00000595683 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.565e-36■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.565e-36■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 02e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.645e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.545e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.225e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 SIPA1-204ENST00000528699 548 ntTSL 213.05□□□□□ -0.325e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 ADAMTSL4-206ENST00000489159 1803 ntTSL 219.62■□□□□ 0.733e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.083e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.073e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.183e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 PTPRS-206ENST00000588552 5443 ntTSL 1 (best)17.27■□□□□ 0.361e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.952e-10■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 SRRM2-217ENST00000573692 459 ntTSL 320.25■□□□□ 0.832e-10■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 SRRM2-218ENST00000574331 1759 ntTSL 219.78■□□□□ 0.762e-10■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.462e-10■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 SRRM2-202ENST00000570539 431 ntTSL 212.66□□□□□ -0.382e-10■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.751e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.321e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.281e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 RPS21-203ENST00000370592 401 ntTSL 214.57□□□□□ -0.087e-39■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 SNHG5-215ENST00000623163 851 ntTSL 517.72■□□□□ 0.437e-13■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 SNHG5-220ENST00000624128 672 ntTSL 210.2□□□□□ -0.787e-13■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 SNHG5-218ENST00000623901 711 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.867e-13■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 SNHG5-217ENST00000623650 886 ntTSL 59.42□□□□□ -0.97e-13■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.712e-7■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.632e-7■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 NIPSNAP2-211ENST00000497279 4255 ntTSL 25.14□□□□□ -1.592e-7■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.815e-8■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.445e-8■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.435e-8■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 C16orf58-210ENST00000568491 2422 ntTSL 216.16■□□□□ 0.185e-8■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.233e-11■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 MINOS1-NBL1-202ENST00000602384 999 ntTSL 521.63■■□□□ 1.053e-11■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 MINOS1-NBL1-203ENST00000602450 590 ntTSL 220.98■□□□□ 0.953e-11■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 MINOS1-203ENST00000467029 583 ntTSL 217.46■□□□□ 0.393e-11■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 MINOS1-209ENST00000498642 669 ntTSL 217.38■□□□□ 0.373e-11■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 MINOS1-NBL1-201ENST00000602293 820 ntTSL 317.37■□□□□ 0.373e-11■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 MINOS1-205ENST00000481464 657 ntTSL 316.49■□□□□ 0.233e-11■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 MINOS1-210ENST00000617872 3678 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.413e-11■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 MINOS1-201ENST00000322753 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.423e-11■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 MINOS1-206ENST00000485362 438 ntTSL 26.98□□□□□ -1.293e-11■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.04□□□□□ -1.284e-6■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.075e-8■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.645e-8■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.635e-8■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.615e-8■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 RDH13-219ENST00000591960 1328 ntTSL 516.27■□□□□ 0.25e-8■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 RDH13-201ENST00000291892 3022 ntTSL 214.39□□□□□ -0.115e-8■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.46e-8■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.266e-8■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 TXNRD2-209ENST00000474308 1854 ntTSL 222.62■■□□□ 1.216e-8■■■□□ 18.1
PABPC4Q13310 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.186e-8■■■□□ 18.1
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