Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RLFQ13129 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RLFQ13129 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RLFQ13129 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RLFQ13129 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RLFQ13129 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RLFQ13129 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RLFQ13129 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RLFQ13129 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLFQ13129 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLFQ13129 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RLFQ13129 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLFQ13129 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RLFQ13129 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLFQ13129 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLFQ13129 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RLFQ13129 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RLFQ13129 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RLFQ13129 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RLFQ13129 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLFQ13129 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RLFQ13129 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLFQ13129 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RLFQ13129 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RLFQ13129 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RLFQ13129 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RLFQ13129 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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