Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CSTF3Q12996 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSTF3Q12996 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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