Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IFFO1Q0D2I5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IFFO1Q0D2I5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms