Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RBBP4Q09028 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RBBP4Q09028 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms