Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD47Q08722 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD47Q08722 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD47Q08722 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD47Q08722 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD47Q08722 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms