Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE4CQ08493 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDE4CQ08493 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms