Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTDSPL2Q05D32 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms