Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC18A2Q05940 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC18A2Q05940 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms