Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CD164Q04900 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CD164Q04900 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CD164Q04900 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CD164Q04900 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CD164Q04900 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CD164Q04900 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CD164Q04900 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CD164Q04900 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CD164Q04900 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CD164Q04900 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
CD164Q04900 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
CD164Q04900 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
CD164Q04900 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms