Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNC4Q03721 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms