Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VLDLRP98155 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms