Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CSNK2A1P68400 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms