Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLF3P57682 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLF3P57682 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLF3P57682 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KLF3P57682 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms