Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLTPP55058 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLTPP55058 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLTPP55058 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLTPP55058 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLTPP55058 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLTPP55058 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PLTPP55058 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLTPP55058 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLTPP55058 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLTPP55058 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLTPP55058 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
PLTPP55058 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLTPP55058 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLTPP55058 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLTPP55058 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLTPP55058 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLTPP55058 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLTPP55058 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLTPP55058 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLTPP55058 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLTPP55058 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PLTPP55058 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLTPP55058 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLTPP55058 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PLTPP55058 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PLTPP55058 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLTPP55058 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLTPP55058 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLTPP55058 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLTPP55058 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLTPP55058 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLTPP55058 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLTPP55058 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLTPP55058 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms