Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKAA2P54646 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms